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제목 (2017-8)RNA-Seq & Microarray 논문 및 바이오뉴스
작성자 ebiogen
작성일자 2017-08-01
조회수 179
안녕하세요? (주)이바이오젠의 RNA-Seq & Microarray 뉴스레터입니다.
(최근 유명저널에 발표된 논문정보와 바이오뉴스 제공)

8월의 매미소리가 시끄럽기 보다는 맘을 시원하게 해주는 소리로 들립니다. 모두들 지혜로운 피서하시길 바랍니다.^^

(주)이바이오젠 올림. (Tel. 02-3141-0791, service@e-biogen.com)
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1. Population and allelic variation of A-to-I RNA editing in human transcriptomes.
Park E, Guo J, Shen S, Demirdjian L, Wu YN, Lin L, Xing Y. Genome Biol. 2017 Jul 28;18(1):143. doi: 10.1186/s13059-017-1270-7.

2. Rare Genome-Wide Copy Number Variation and Expression of Schizophrenia in 22q11.2 Deletion Syndrome.
Bassett AS, Lowther C, Merico D, Costain G, Chow EWC, van Amelsvoort T, McDonald-McGinn D, Gur RE, Swillen A, Van den Bree M, Murphy K, Gothelf D, Bearden CE, Eliez S, Kates W, Philip N et al.; International 22q11.2DS Brain and Behavior Consortium. Am J Psychiatry. 2017 Jul 28:appiajp201716121417. doi: 10.1176/appi.ajp.2017.16121417.

3. Rapid evolution of female-biased genes among four species of Anopheles malaria mosquitoes.
Papa F, Windbichler N, Waterhouse RM, Cagnetti A, D'Amato R, Persampieri T, Lawniczak MKN, Nolan T, Papathanos PA. Genome Res. 2017 Jul 26. pii: gr.217216.116. doi: 10.1101/gr.217216.116.

4. The evolution of duplicate gene expression in mammalian organs.
Guschanski K, Warnefors M, Kaessmann H. Genome Res. 2017 Jul 25. pii: gr.215566.116. doi: 10.1101/gr.215566.116.

5. PLATE-Seq for genome-wide regulatory network analysis of high-throughput screens.
Bush EC, Ray F, Alvarez MJ, Realubit R, Li H, Karan C, Califano A, Sims PA. Nat Commun. 2017 Jul 24;8(1):105. doi: 10.1038/s41467-017-00136-z.

6. Activin signaling mediates muscle-to-adipose communication in a mitochondria dysfunction-associated obesity model.
Song W, Owusu-Ansah E, Hu Y, Cheng D, Ni X, Zirin J, Perrimon N. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jul 24. pii: 201708037. doi: 10.1073/pnas.1708037114.

7. MATCHER: manifold alignment reveals correspondence between single cell transcriptome and epigenome dynamics.
Welch JD, Hartemink AJ, Prins JF. Genome Biol. 2017 Jul 24;18(1):138. doi: 10.1186/s13059-017-1269-0.

8. Human iPSC Glial Mouse Chimeras Reveal Glial Contributions to Schizophrenia.
Windrem MS, Osipovitch M, Liu Z, Bates J, Chandler-Militello D, Zou L, Munir J, Schanz S, McCoy K, Miller RH, Wang S, Nedergaard M, Findling RL, Tesar PJ, Goldman SA. Cell Stem Cell. 2017 Jul 18. pii: S1934-5909(17)30238-2. doi: 10.1016/j.stem.2017.06.012.

9. MYC2 Orchestrates a Hierarchical Transcriptional Cascade that Regulates Jasmonate-Mediated Plant Immunity in Tomato.
Du M, Zhao J, Tzeng DTW, Liu Y, Deng L, Yang T, Zhai Q, Wu F, Huang Z, Zhou M, Wang Q, Chen Q, Zhong S, Li CB, Li C. Plant Cell. 2017 Jul 21. pii: tpc.00953.2016. doi: 10.1105/tpc.16.00953.

10. Multi-Cellular Transcriptional Analysis of Mammalian Heart Regeneration.
Quaife-Ryan GA, Sim CB, Ziemann M, Kaspi A, Rafehi H, Ramialison M, El-Osta A, Hudson JE, Porrello ER. Circulation. 2017 Jul 21. pii: CIRCULATIONAHA.117.028252. doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.117.028252.

11. KMT2A and KMT2B Mediate Memory Function by Affecting Distinct Genomic Regions.
Kerimoglu C, Sakib MS, Jain G, Benito E, Burkhardt S, Capece V, Kaurani L, Halder R, Agis-Balboa RC, Stilling R, Urbanke H, Kranz A, Stewart AF, Fischer A. Cell Rep. 2017 Jul 18;20(3):538-548. doi: 10.1016/j.celrep.2017.06.072.

12. Rare coding variants in PLCG2, ABI3, and TREM2 implicate microglial-mediated innate immunity in Alzheimer's disease.
Sims R, van der Lee SJ, Naj AC, Bellenguez C, Badarinarayan N, Jakobsdottir J et al. Nat Genet. 2017 Jul 17. doi: 10.1038/ng.3916.

13. Neural Circuit-Specialized Astrocytes: Transcriptomic, Proteomic, Morphological, and Functional Evidence.
Chai H, Diaz-Castro B, Shigetomi E, Monte E, Octeau JC, Yu X, Cohn W, Rajendran PS, Vondriska TM, Whitelegge JP, Coppola G, Khakh BS. Neuron. 2017 Jul 11. pii: S0896-6273(17)30553-6. doi: 10.1016/j.neuron.2017.06.029.

14. Rapid recovery gene downregulation during excess-light stress and recovery in Arabidopsis.
Crisp PA, Ganguly D, Smith AB, Murray KD, Estavillo GM, Searle IR, Ford E, Bogdanovi? O, Lister R, Borevitz JO, Eichten SR, Pogson BJ. Plant Cell. 2017 Jul 13. pii: tpc.00828.2016. doi: 10.1105/tpc.16.00828.

15. Neat1 is a p53-inducible lincRNA essential for transformation suppression.
Mello SS, Sinow C, Raj N, Mazur PK, Bieging-Rolett K, Broz DK, Imam JFC, Vogel H, Wood LD, Sage J, Hirose T, Nakagawa S, Rinn J, Attardi LD. Genes Dev. 2017 Jun 1;31(11):1095-1108. doi: 10.1101/gad.284661.116. Epub 2017 Jul 11.

16. Functional characterization of human pluripotent stem cell-derived arterial endothelial cells.
Zhang J, Chu LF, Hou Z, Schwartz MP, Hacker T, Vickerman V, Swanson S, Leng N, Nguyen BK, Elwell A, Bolin J, Brown ME, Stewart R, Burlingham WJ, Murphy WL, Thomson JA. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jul 25;114(30):E6072-E6078. doi: 10.1073/pnas.1702295114. Epub 2017 Jul 10.

17. Suboptimal T-cell receptor signaling compromises protein translation, ribosome biogenesis, and proliferation of mouse CD8 T cells.
Tan TCJ, Knight J, Sbarrato T, Dudek K, Willis AE, Zamoyska R. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jul 25;114(30):E6117-E6126. doi: 10.1073/pnas.1700939114. Epub 2017 Jul 10.

18. Use of Biomarkers to Guide Decisions on Adjuvant Systemic Therapy for Women With Early-Stage Invasive Breast Cancer: American Society of Clinical Oncology Clinical Practice Guideline Focused Update.
Krop I, Ismaila N, Andre F, Bast RC, Barlow W, Collyar DE, Hammond ME, Kuderer NM, Liu MC, Mennel RG, Van Poznak C, Wolff AC, Stearns V. J Clin Oncol. 2017 Jul 10:JCO2017740472. doi: 10.1200/JCO.2017.74.0472.

19. Annotation and cluster analysis of spatiotemporal- and sex-related lncRNA expression in Rhesus macaque brain.
Liu S, Wang Z, Chen D, Zhang B, Tian R, Wu J, Zhang Y, Xu K, Yang L, Cheng C, Ma J, Lv L, Zheng Y, Hu X, Zhang Y, Wang X, Li J. Genome Res. 2017 Jul 7. pii: gr.217463.116. doi: 10.1101/gr.217463.116.

20. Intestinal Enteroendocrine Lineage Cells Possess Homeostatic and Injury-Inducible Stem Cell Activity.
Yan KS, Gevaert O, Zheng GXY, Anchang B, Probert CS, Larkin KA, Davies PS, Cheng ZF, Kaddis JS, Han A, Roelf K, Calderon RI, Cynn E, Hu X, Mandleywala K, Wilhelmy J, Grimes SM, Corney DC, et al. Cell Stem Cell. 2017 Jul 6;21(1):78-90.e6. doi: 10.1016/j.stem.2017.06.014.

21. Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by performing a broad-spectrum RNA-seq analysis.
Sahraeian SME, Mohiyuddin M, Sebra R, Tilgner H, Afshar PT, Au KF, Bani Asadi N, Gerstein MB, Wong WH, Snyder MP, Schadt E, Lam HYK. Nat Commun. 2017 Jul 5;8(1):59. doi: 10.1038/s41467-017-00050-4.

22. Cytokinin induces genome-wide binding of the type-B response regulator ARR10 to regulate growth and development in Arabidopsis.
Zubo YO, Blakley IC, Yamburenko MV, Worthen JM, Street IH, Franco-Zorrilla JM, Zhang W, Hill K, Raines T, Solano R, Kieber JJ, Loraine AE, Schaller GE. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Jul 18;114(29):E5995-E6004. doi: 10.1073/pnas.1620749114. Epub 2017 Jul 3.

23. Heparan Sulfate Microarray Reveals That Heparan Sulfate-Protein Binding Exhibits Different Ligand Requirements.
Zong C, Venot A, Li X, Lu W, Xiao W, Wilkes JL, Salanga CL, Handel TM, Wang L, Wolfert MA, Boons GJ. J Am Chem Soc. 2017 Jul 19;139(28):9534-9543. doi: 10.1021/jacs.7b01399. Epub 2017 Jul 7.

24. Progesterone Receptor Isoform Ratio: A Breast Cancer Prognostic and Predictive Factor for Antiprogestin Responsiveness.
Rojas PA, May M, Sequeira GR, Elia A, Alvarez M, Martinez P, Gonzalez P, Hewitt S, He X, Perou CM, Molinolo A, Gibbons L, Abba MC, Gass H, Lanari C. J Natl Cancer Inst. 2017 Jul 1;109(7). doi: 10.1093/jnci/djw317.

25. Microbes Are Associated with Host Innate Immune Response in Idiopathic Pulmonary Fibrosis.
Huang Y, Ma SF, Espindola MS, Vij R, Oldham JM, Huffnagle GB, Erb-Downward JR, Flaherty KR, Moore BB, White ES, Zhou T, Li J, Lussier YA, Han MK, Kaminski N, Garcia JGN, Hogaboam CM, Martinez FJ, Noth I; COMET-IPF Investigators. Am J Respir Crit Care Med. 2017 Jul 15;196(2):208-219. doi: 10.1164/rccm.201607-1525OC.

1. 2m 길이 DNA가 4㎛ 세포핵에 쏙 들어가는 비밀은
2. 남겨진 DNA로 범인 행동 분석까지…진화하는 과학수사
3. 수박에 갈고리 패턴이 보이면 무조건 먹지 말아야 하나?
4. 제브라피쉬는 앞을 보지 않고 어떻게 헤엄을 칠까
5. 내 뇌에 너의 기억을 심으면 나는 너일까, 나일까?
6. 단 한번의 치료로 알레르기 근절한다
7. 실시간으로 당뇨 진단하는 콘택트렌즈 나왔다
8. 공기방울로 세포 이동시킨다
9. 지카 바이러스 치료제 찾았다
10. 첫사랑의 기억이 오래가는 이유? 어느 연구자의 결론
11. 치매 유전자 돼지로 신약 개발할까
12. 치매 악화시키는 타우 단백질 정밀 구조 밝혔다
13. 알츠하이머 치료 효과 보려면…
14. 드라마 속 '충격으로 인한 기억상실증' 왜 생기나
15. [카드뉴스] 유전자가 말할 수 있는 진실
16. 자동차 배기가스에 어린이 DNA 손상
17. 크리스퍼, 표적 외 다른 유전자에 변형 일으켜
18. 수술 중 조영제+지혈=‘나노 접착제’로 한번에
19. 냄새 못 맡으면 살도 빠진다?
20. 임신중 비만 엄마, 아들에게 어떤 영향이 끼칠까
21. 또 다른 식욕억제호르몬 찾았다!
22. 호흡으로 질병 진단하는 센서 개발
23. 실험실에서 만든 인공장기, 실제와 얼마나 유사할까
24. 피부세포→신경세포 변신시켜 파킨슨병 고친다
25. “줄기세포 효과, 이젠 눈으로 확인한다”
26. 치매 등 퇴행성 뇌질환 초기 치료법 찾았다
27. 조류 독감, 인간에게 퍼뜨릴 수 있는 ‘돌연변이’
28. ‘황금박쥐’가 멸종위기종이 된 이유
29. 목숨 위협하는 패혈증, 나노 입자로 생존률 2.5배 높였다
30. 과학자들이 세포 하나에 관심을 갖는 이유
31. 빛으로 수면 뇌파 조절하면 학습내용 2배 잘 기억한다
32. 우울증 일으키는 핵심 유전자 찾았다
- 위 기사는 동아사이언스(http://www.dongascience.com/)에서 제공하고 링크클릭시 해당 사이트로 이동하여 기사내용을 보실수 있습니다.
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